A metodologia de trabalho do CEI Isabel Longo segue várias linhas de pensamento como: Sócio construtivista, Sócio interacionista e outras, pois as crianças são estimuladas a dialogar, questionar e partilhar saberes, nas diferentes situações sociais, abrindo espaço para as diferenças, o erro, as contradições, a criatividade e criticidade. Considera-se importante o equilíbrio e harmonia das dimensões cognitivas, física, psíquica e social da criança que é fruto da compreensão do mundo, do outro e de si mesmo. Na busca pela educação integral da criança, nos baseamos em quatro tipos de aprendizagens: -Aprender a conhecer (adquirir conhecimentos); -Aprender a fazer (desenvolver competências); -Aprender a conviver (perceber as interdependências, ser capaz de viver e trabalhar em grupo); -Aprender a ser (agir com maior autonomia, discernimento e responsabilidade social).